События Red Faction: Armageddon происходят спустя полстолетия после восстания и освобождения Марса от Сил Земной Защиты. Однако мир на красной планете продержался недолго, и теперь новая смертельная угроза нависла над жителями Марса. Все начинается с того, что массивный Терраформер, который поддерживал на планете атмосферу, похожую на Земную, был уничтожен. Жить на поверхности теперь стало нереально из-за постоянных торнадо, штормов и других погодных катаклизмов. Чтобы выжить, колонисты отступили в подземные шахты и построили там сеть из обитаемых пещер.

Действие игры происходит в волшебном городе Рио, куда, после похищения, были доставлены, полюбившиеся многим, Злые Птички. В конечном итоге они уходят от похитителей и отправляются спасать своих друзей, Blu и Jewel – редких попугаев и героев мультфилма «Рио».

Жизнь Крошечной планеты была тиха и беззаботна, пока однажды не случилось беда - в нее врезался астероид. Крошечный мир раскололся на части, и теперь его будущее зависит только от вас! Проявите фантазию и сообразительность - разгадывайте загадки и чините хитроумные машины. Ведь только так можно спасти этот удивительный крохотный мир.